MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 41182

< Previous12...71727374757677787980818283Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_017846	TTCTCG	2	12	2298889	2298900	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387122077
41002	NC_017846	TAT	2	6	2298901	2298906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122077
41003	NC_017846	GTT	2	6	2298947	2298952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122077
41004	NC_017846	CTA	2	6	2299002	2299007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122077
41005	NC_017846	CTTT	2	8	2299110	2299117	0 %	75 %	0 %	25 %	387122077
41006	NC_017846	GAA	3	9	2299122	2299130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387122077
41007	NC_017846	GC	3	6	2299131	2299136	0 %	0 %	50 %	50 %	387122077
41008	NC_017846	ATT	2	6	2299176	2299181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122077
41009	NC_017846	ACC	2	6	2299185	2299190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387122077
41010	NC_017846	TAT	2	6	2299223	2299228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122077
41011	NC_017846	GCT	2	6	2299320	2299325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387122077
41012	NC_017846	TTA	2	6	2299332	2299337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122077
41013	NC_017846	GC	3	6	2299350	2299355	0 %	0 %	50 %	50 %	387122077
41014	NC_017846	CTGC	2	8	2299396	2299403	0 %	25 %	25 %	50 %	387122077
41015	NC_017846	TTTA	2	8	2299420	2299427	25 %	75 %	0 %	0 %	387122077
41016	NC_017846	AAC	2	6	2299502	2299507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387122078
41017	NC_017846	TGT	2	6	2299538	2299543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122078
41018	NC_017846	GCA	2	6	2299630	2299635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122078
41019	NC_017846	GC	3	6	2299670	2299675	0 %	0 %	50 %	50 %	387122078
41020	NC_017846	TCA	2	6	2299699	2299704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122078
41021	NC_017846	TTA	2	6	2299849	2299854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122078
41022	NC_017846	TCA	2	6	2299855	2299860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122078
41023	NC_017846	GA	3	6	2299872	2299877	50 %	0 %	50 %	0 %	387122078
41024	NC_017846	AGC	2	6	2299878	2299883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122078
41025	NC_017846	ATT	2	6	2299921	2299926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122078
41026	NC_017846	A	6	6	2299983	2299988	100 %	0 %	0 %	0 %	387122078
41027	NC_017846	CAC	2	6	2300026	2300031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387122078
41028	NC_017846	GCA	2	6	2300041	2300046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122078
41029	NC_017846	AGA	2	6	2300193	2300198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387122078
41030	NC_017846	A	6	6	2300292	2300297	100 %	0 %	0 %	0 %	387122079
41031	NC_017846	CACGCA	2	12	2300346	2300357	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387122079
41032	NC_017846	CCG	2	6	2300392	2300397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387122079
41033	NC_017846	TCA	2	6	2300431	2300436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122079
41034	NC_017846	ATG	2	6	2300470	2300475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122079
41035	NC_017846	ATC	2	6	2300484	2300489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122079
41036	NC_017846	AAC	2	6	2300494	2300499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387122079
41037	NC_017846	GCG	2	6	2300530	2300535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387122079
41038	NC_017846	GCA	3	9	2300726	2300734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122079
41039	NC_017846	GTG	2	6	2300762	2300767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387122079
41040	NC_017846	AAG	2	6	2300844	2300849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387122079
41041	NC_017846	AAT	3	9	2300984	2300992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122079
41042	NC_017846	GCG	2	6	2300993	2300998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387122079
41043	NC_017846	ACA	2	6	2301006	2301011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387122079
41044	NC_017846	GCGT	2	8	2301033	2301040	0 %	25 %	50 %	25 %	387122079
41045	NC_017846	AGTT	2	8	2301060	2301067	25 %	50 %	25 %	0 %	387122079
41046	NC_017846	AGCCA	2	10	2301167	2301176	40 %	0 %	20 %	40 %	387122079
41047	NC_017846	TTG	2	6	2301332	2301337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122079
41048	NC_017846	TAAA	2	8	2301366	2301373	75 %	25 %	0 %	0 %	387122079
41049	NC_017846	AATG	2	8	2301578	2301585	50 %	25 %	25 %	0 %	387122079
41050	NC_017846	GGC	2	6	2301586	2301591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387122079
41051	NC_017846	ACA	2	6	2301603	2301608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387122079
41052	NC_017846	CAT	2	6	2301690	2301695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122079
41053	NC_017846	CCA	2	6	2301706	2301711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387122079
41054	NC_017846	GTGGC	2	10	2301738	2301747	0 %	20 %	60 %	20 %	387122079
41055	NC_017846	ATT	2	6	2301789	2301794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122079
41056	NC_017846	AAT	2	6	2301845	2301850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122079
41057	NC_017846	GTA	2	6	2301873	2301878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122079
41058	NC_017846	GTT	2	6	2302024	2302029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122079
41059	NC_017846	ACC	2	6	2302091	2302096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387122079
41060	NC_017846	GGT	2	6	2302112	2302117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387122079
41061	NC_017846	GCAA	2	8	2302136	2302143	50 %	0 %	25 %	25 %	387122079
41062	NC_017846	CAAC	2	8	2302182	2302189	50 %	0 %	0 %	50 %	387122079
41063	NC_017846	GAT	2	6	2302262	2302267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122079
41064	NC_017846	TTTA	2	8	2302273	2302280	25 %	75 %	0 %	0 %	387122079
41065	NC_017846	CTT	2	6	2302407	2302412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387122079
41066	NC_017846	CAAA	2	8	2302426	2302433	75 %	0 %	0 %	25 %	387122079
41067	NC_017846	A	6	6	2302431	2302436	100 %	0 %	0 %	0 %	387122079
41068	NC_017846	ACC	2	6	2302475	2302480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387122079
41069	NC_017846	ATC	2	6	2302503	2302508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122079
41070	NC_017846	AAT	2	6	2302583	2302588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122079
41071	NC_017846	GCAC	2	8	2302625	2302632	25 %	0 %	25 %	50 %	387122079
41072	NC_017846	AATG	2	8	2302683	2302690	50 %	25 %	25 %	0 %	387122079
41073	NC_017846	ATT	2	6	2302803	2302808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122080
41074	NC_017846	TGG	2	6	2302899	2302904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387122080
41075	NC_017846	CCG	3	9	2302919	2302927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387122080
41076	NC_017846	ACT	2	6	2303095	2303100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122081
41077	NC_017846	TGT	2	6	2303127	2303132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122081
41078	NC_017846	GTA	2	6	2303159	2303164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122081
41079	NC_017846	GCC	2	6	2303235	2303240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387122081
41080	NC_017846	CTT	2	6	2303257	2303262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387122081
41081	NC_017846	ATT	2	6	2303315	2303320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122081
41082	NC_017846	T	6	6	2303362	2303367	0 %	100 %	0 %	0 %	387122081
41083	NC_017846	TTG	2	6	2303385	2303390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122081
41084	NC_017846	CTG	2	6	2303394	2303399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387122081
41085	NC_017846	GAT	2	6	2303402	2303407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122081
41086	NC_017846	TGG	2	6	2303443	2303448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387122081
41087	NC_017846	ACC	2	6	2303486	2303491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387122081
41088	NC_017846	GCC	2	6	2303525	2303530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387122081
41089	NC_017846	TAA	2	6	2303540	2303545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122081
41090	NC_017846	TGAA	2	8	2303609	2303616	50 %	25 %	25 %	0 %	387122081
41091	NC_017846	TGT	2	6	2303626	2303631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122081
41092	NC_017846	GCC	2	6	2303675	2303680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387122081
41093	NC_017846	TTC	2	6	2303709	2303714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387122081
41094	NC_017846	T	6	6	2303786	2303791	0 %	100 %	0 %	0 %	387122081
41095	NC_017846	AG	3	6	2303792	2303797	50 %	0 %	50 %	0 %	387122081
41096	NC_017846	TTC	2	6	2303828	2303833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387122081
41097	NC_017846	CTT	2	6	2303869	2303874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387122081
41098	NC_017846	GGT	2	6	2303921	2303926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387122081
41099	NC_017846	CTA	2	6	2303932	2303937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122081
41100	NC_017846	GCC	2	6	2303948	2303953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387122081
41101	NC_017846	TAA	2	6	2303954	2303959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122081
41102	NC_017846	TTG	2	6	2303973	2303978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122081
41103	NC_017846	TGA	2	6	2304046	2304051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122081
41104	NC_017846	TG	3	6	2304060	2304065	0 %	50 %	50 %	0 %	387122081
41105	NC_017846	CAG	2	6	2304074	2304079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122081
41106	NC_017846	T	7	7	2304115	2304121	0 %	100 %	0 %	0 %	387122081
41107	NC_017846	TTC	2	6	2304245	2304250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387122082
41108	NC_017846	ATA	2	6	2304354	2304359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122082
41109	NC_017846	TCA	2	6	2304441	2304446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122082
41110	NC_017846	GCT	2	6	2304496	2304501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387122082
41111	NC_017846	CGC	3	9	2304505	2304513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387122082
41112	NC_017846	TCT	2	6	2304588	2304593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387122082
41113	NC_017846	CG	3	6	2304595	2304600	0 %	0 %	50 %	50 %	387122082
41114	NC_017846	GGC	2	6	2304623	2304628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387122082
41115	NC_017846	TGC	2	6	2304681	2304686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387122082
41116	NC_017846	TTTG	2	8	2304712	2304719	0 %	75 %	25 %	0 %	387122082
41117	NC_017846	GTT	2	6	2304727	2304732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122082
41118	NC_017846	GCAAT	2	10	2304786	2304795	40 %	20 %	20 %	20 %	387122082
41119	NC_017846	AGC	2	6	2304840	2304845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122082
41120	NC_017846	CGCC	2	8	2304847	2304854	0 %	0 %	25 %	75 %	387122082
41121	NC_017846	AAAGT	2	10	2304905	2304914	60 %	20 %	20 %	0 %	387122082
41122	NC_017846	TCA	2	6	2304934	2304939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122082
41123	NC_017846	GC	3	6	2304981	2304986	0 %	0 %	50 %	50 %	387122083
41124	NC_017846	ATT	2	6	2305105	2305110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122083
41125	NC_017846	AAT	2	6	2305141	2305146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122083
41126	NC_017846	AC	3	6	2305177	2305182	50 %	0 %	0 %	50 %	387122083
41127	NC_017846	CAT	2	6	2305300	2305305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122083
41128	NC_017846	GCT	2	6	2305313	2305318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387122083
41129	NC_017846	GTG	2	6	2305319	2305324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387122083
41130	NC_017846	ATC	2	6	2305331	2305336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122083
41131	NC_017846	CAT	2	6	2305456	2305461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122083
41132	NC_017846	ATA	2	6	2305475	2305480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122083
41133	NC_017846	TCG	2	6	2305500	2305505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387122083
41134	NC_017846	CCG	2	6	2305617	2305622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387122083
41135	NC_017846	GCC	2	6	2305636	2305641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387122083
41136	NC_017846	AC	3	6	2305644	2305649	50 %	0 %	0 %	50 %	387122083
41137	NC_017846	GCC	2	6	2305718	2305723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387122083
41138	NC_017846	TGT	2	6	2305773	2305778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122083
41139	NC_017846	CAC	2	6	2305816	2305821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387122083
41140	NC_017846	AAC	2	6	2305862	2305867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387122083
41141	NC_017846	AGT	2	6	2305892	2305897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122083
41142	NC_017846	GAT	2	6	2305908	2305913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122083
41143	NC_017846	GGT	2	6	2306177	2306182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387122084
41144	NC_017846	AGGAG	2	10	2306235	2306244	40 %	0 %	60 %	0 %	387122084
41145	NC_017846	TGT	2	6	2306319	2306324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122084
41146	NC_017846	CAAA	2	8	2306360	2306367	75 %	0 %	0 %	25 %	387122084
41147	NC_017846	A	6	6	2306386	2306391	100 %	0 %	0 %	0 %	387122084
41148	NC_017846	GTA	2	6	2306453	2306458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122084
41149	NC_017846	TTTTA	2	10	2306478	2306487	20 %	80 %	0 %	0 %	387122084
41150	NC_017846	CAT	2	6	2306501	2306506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122084
41151	NC_017846	GAT	2	6	2306773	2306778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122085
41152	NC_017846	GAAA	2	8	2306818	2306825	75 %	0 %	25 %	0 %	387122085
41153	NC_017846	ACA	2	6	2306882	2306887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387122085
41154	NC_017846	TTA	2	6	2306950	2306955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122085
41155	NC_017846	AAT	2	6	2307027	2307032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122085
41156	NC_017846	TAT	2	6	2307040	2307045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122086
41157	NC_017846	ACG	2	6	2307062	2307067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122086
41158	NC_017846	CGG	2	6	2307072	2307077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387122086
41159	NC_017846	ATT	2	6	2307157	2307162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122086
41160	NC_017846	CCAAG	2	10	2307202	2307211	40 %	0 %	20 %	40 %	387122086
41161	NC_017846	AAAG	2	8	2307537	2307544	75 %	0 %	25 %	0 %	387122087
41162	NC_017846	AAG	2	6	2307554	2307559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387122087
41163	NC_017846	GCA	2	6	2307611	2307616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122087
41164	NC_017846	ACG	2	6	2307694	2307699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387122087
41165	NC_017846	ATT	2	6	2307798	2307803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122087
41166	NC_017846	ATT	2	6	2307820	2307825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387122087
41167	NC_017846	A	6	6	2307877	2307882	100 %	0 %	0 %	0 %	387122087
41168	NC_017846	TAC	2	6	2307893	2307898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122087
41169	NC_017846	ATG	3	9	2307926	2307934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122087
41170	NC_017846	TCC	2	6	2308044	2308049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387122087
41171	NC_017846	T	7	7	2308134	2308140	0 %	100 %	0 %	0 %	387122087
41172	NC_017846	TTTTA	2	10	2308142	2308151	20 %	80 %	0 %	0 %	387122087
41173	NC_017846	TTG	2	6	2308158	2308163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387122087
41174	NC_017846	T	6	6	2308183	2308188	0 %	100 %	0 %	0 %	387122087
41175	NC_017846	AGG	2	6	2308271	2308276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387122087
41176	NC_017846	CAT	3	9	2308387	2308395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387122088
41177	NC_017846	GTA	2	6	2308423	2308428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387122088
41178	NC_017846	T	6	6	2308439	2308444	0 %	100 %	0 %	0 %	387122088
41179	NC_017846	AAT	2	6	2308495	2308500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122088
41180	NC_017846	AAT	2	6	2308517	2308522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387122088
41181	NC_017846	TCG	2	6	2308620	2308625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387122088
41182	NC_017846	TGC	2	6	2308704	2308709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387122088

< Previous12...71727374757677787980818283Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.